Depuis la création du CRIOAc Lyon, la recherche dans le domaine des IOA, et la formation des nos internes et chercheurs est une de nos priorités.

Dans le but de mieux connaître la physiopathologie et le traitement de ces infections, nous encadrons constamment des étudiants pour leur thèse de médecine, de pharmacie ou pour l’obtention d’un Doctorat d’Université.

Toutes les thèses du CRIOAc Lyon sont téléchargeables au format pdf, en accès libre.

2024

THÈSE DE PHARMACIE

  • thèse d'Alexandra Duffour
  • le 19/06/2024
PROFIL DE TOLÉRANCE DU LINÉZOLIDE EN HORS-AMM : ÉTUDE DE COHORTE CHEZ LES PATIENTS TRAITÉS POUR UNE INFECTION OSTÉO-ARTICULAIRE
L’antibiorésistance représente un problème majeur de santé publique en France et dans le monde (1). Les souches bactériennes à Cocci Gram positif multi-résistantes, incluant les staphylocoques et les entérocoques, sont associées à une augmentation de la morbidité et de la mortalité des infections (2). La vancomycine est l’antibiotique de première intention dans la prise en charge de ces infections (3).

2023

Diagnostic, clinical management and outcome of bone flap-related osteomyelitis following cranioplasty
International Journal of Infectious Diseases Volume 137, December 2023, Pages 48-54
free access
Objectives: To describe diagnostic, management and outcome of bone flap-related osteomyelitis following cranioplasty. Methods: Patients followed-up in our tertiary care hospital for a bone flap-related osteomyelitis after cranioplasty were included in a retrospective cohort (2008-2021). Determinants of treatment failure were assessed using logistic regression and Kaplan-Meier curves analysis.

THÈSES DE DOCTORAT D’UNIVERSITÉ

  • thèse de Romain Garreau
  • le 29/09/2023
Modélisation Pharmacocinétique et Pharmacodynamique de la daptomycine dans les infections ostéoarticulaires
La daptomycine est un antibiotique utilisé dans les infections-ostéoarticulaires. Plusieurs travaux ont montré l’intérêt d’utiliser des doses > 6 mg/kg dans ces infections. Cependant, la sécurité et l’efficacité de ces doses n’ont été que peu étudiées dans les infections ostéoarticulaires car cette indication reste non-validée par l’autorisation de mise sur le marché. L’objectif de ce travail de thèse est de

Thèse de médecine

  • thèse de Agathe Bonnaire
  • le 27/09/2023
Ostéomyélite chronique des os longs de l’adulte de stade III selon Cierny et Mader : Etude rétrospective au Centre de Référence des Infections Ostéo-Articulaires complexes (CRIOAc) de Lyon
Les ostéomyélites chroniques sont des infections menaçant le pronostic fonctionnel et plus rarement vital des patients. Malgré un traitement de référence bien conduit, le taux d’échec thérapeutique reste important, entre 15 et 22% selon les données récentes de la littérature. L’absence de comblement du défect osseux est l’un des facteurs de risque de récidive infectieuse et donc d’échec thérapeutique, notamment

2020

Thèses de médecine

  • thèse de William Danjou
  • le 29/10/2020
OTITES EXTERNES NECROSANTES, EPIDEMIOLOGIE FACTEURS DE RISQUE DE RECHUTE
Introduction: L’otite externe nécrosante est une infection grave de la base du crâne qui survient généralement chez les personnes âgées et/ou les patients diabétiques. Il existe peu de données dans la littérature sur la gestion thérapeutique de cette infection complexe des os et des articulations. Le but de notre étude était de déterminer les facteurs de risque de rechute. Matériel
  • thèse de Gaëlle Bourgeois
  • le 23/09/2020
HISTOIRE DE LA PHAGOTHERAPIE A LYON
L’utilisation des bactériophages à visée thérapeutique ou phagothérapie, a été mise au point au début du vingtième siècle par Félix D’Hérelle. Cette thérapeutique s’est développée en Europe et dans le monde avec des résultats prometteurs avant d’être supplantée par l’avènement de l’antibiothérapie à l’aube de la Seconde Guerre mondiale. Elle est initialement écartée de l’arsenal anti bactérien avant d’être progressivement

thèses de pharmacie

  • Thèse de Mathilde Ballet
  • le 01/07/2020
IMPACT DE L’AJOUT D’ANTIBIOTIQUES DANS LES CIMENTS ORTHOPEDIQUES SUR LA PREVENTION DE LA FORMATION DE BIOFILM AU COURS D’INFECTIONS SUR PROTHESE ARTICULAIRE A STAPHYLOCOCCUS AUREUS
La pose de prothèses articulaires est en plein essor, mais n’est pas sans risque. Elle est associée à des complications sérieuses comme des infections. Afin de les prévenir, il est possible d’ajouter des antibiotiques aux ciments orthopédiques employés pour améliorer la fixation de la prothèse au tissu osseux. Ceux-ci permettent une libération prolongée des antibiotiques et donc une concentration locale

2019

THÈSES DE MÉDECINE

  • thèse de Florian Bourbotte-Salmon
  • le 25/11/2019
Reprises de prothèses totales de genou septiques par charnière : 50 cas avec 2 à 7 ans de recul
Introduction : Notre étude se proposait d’étudier les arthroplasties par prothèse à charnière dans l’indication de révision de prothèse totale de genou (PTG) septique. L’hypothèse était que l’utilisation des PTG charnières dans les révisions septiques offrait des résultats satisfaisants en terme de survie et de scores fonctionnels. Matériels et méthodes : 50 patients ayant bénéficié d’une prothèse totale du genou

Thèses de Pharmacie

  • thèse de Camille Kolenda
  • le 12/03/2019
Phagothérapie et infections ostéo-articulaires : évaluation de l’activité antibiofilm et antibactérienne intracellulaire d’un assemblage de trois bactériophages anti-Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus est le premier agent causal des infections ostéo-articulaires (IOA). Il entraine fréquemment des formes chroniques difficiles à traiter en raison de sa capacité à former des biofilms, à être internalisé et à persister dans les ostéoblastes. La phagothérapie constitue une des alternatives thérapeutiques suscitant actuellement le plus d’intérêt pour améliorer la prise en charge de ces infections. Dans

2018

THÈSES DE MÉDECINE

  • thèse de Matteo Cerioli
  • le 17/10/2018

Thèses de pharmacie

  • thèse de Constance Bretagnolle
  • le 09/10/2018
Étude pilote sur l’observance des antibiotiques administrés par voie orale dans les infections ostéo-articulaires
L’observance médicamenteuse est définie par l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) comme le « le degré de concordance (ou d’adéquation) entre le comportement d’une personne (prise de médicament, suivi d’un régime et/ou modifications du comportement) et les recommandations d’un soignant ». Dans les pays développés, on estime que seulement 50% des patients traités au long cours pour des pathologies chroniques
  • thèse de Chloé Chazaud
  • le 10/10/2018
Augmentation du risque d’insuffisance rénale aigue lors de l’utilisation concomitante de vancomycine et piperacilline tazobactam : analyse de la base nationale de pharmacovigilance
L’insuffisance rénale aigue (IRA) est une atteinte fréquente et potentiellement grave augmentant la morbidité et la mortalité. La néphrotoxicité médicamenteuse est une des étiologies de l’IRA et certains médicaments, tels que la vancomycine (VAN), nécessitent une surveillance accrue de la fonction rénale. En novembre 2016, au centre de pharmacovigilance de Lyon, a été observée une augmentation des notifications d’IRA liée

2017

Thèses de Médecine

  • thèse de Romain Bricca
  • le 24/10/2017
Analyse pharmacocinétique des populations de la daptomycine chez les patients atteints d’infections ostéo-articulaires
Daptomycin is validated as a treatment of bone and joint infections (BJI) by the Infectious Disease Society of America. Dosage adaptation is currently exclusively adapted on the weight and the creatinine clearance. However, other factors such as sex and P-glycoprotein polymorphism, encoded by ABCB1 gene, may also greatly influence the pharmacokinetics. Between 2013 and 2016, all patients follow in French
  • thèse de Sophie Chabbert
  • le 07/07/2017
Otite externe nécrosante : évaluation globale d’une prise en charge dans un centre hospitalo-universitaire avec analyse des échecs thérapeutiques
L’otite externe nécrosante est une maladie rare, de diagnostic difficile, souvent grave. Aucune recommandation de pratique clinique ou radiologique n’existe pour cette pathologie. Un scanner des rochers est le plus souvent réalisé en première intention à la recherche d’une lyse osseuse, ainsi qu’une imagerie par résonance magnétique (IRM) pour préciser l’extension locale. La scintigraphie osseuse aux diphosphonates marqués au Technétium
  • thèse de Johan Andrianasolo
  • le 10/04/2017
Ostéite chronique sur escarres pelviennes : Etude d’une stratégie de débridement, thérapie à pression négative (TPN), antibiothérapie (1er temps) et lambeau de couverture (2ème temps)
Introduction : Les ostéites pelviennes sur escarre bénéficient généralement d’une prise en charge complexe en 2 temps. Toutefois, peu d’études ont évalué une telle stratégie. Matériel et méthodes : Les ostéites pelviennes (critères cliniques, radiologiques et microbiologiques) sur escarre prises en charge en 2 temps ont été incluses dans une cohorte rétrospective dans un Centre de Référence pour la prise

Thèses de Doctorat d’Université

  • thèse de Jason Tasse
  • le 06/07/2017
Apport de l’antibiofilmogramme et de la mesure de la capacité de formation du biofilm dans la prise en charge des infections ostéo-articulaires à staphylocoques
Dans le cadre des infections ostéo-articulaires (IOA), l’utilisation de matériels étrangers peut, en cas de contamination, aboutir à la formation d’un biofilm associé à un risque plus important d’échec du traitement et de récidive. Les bactéries sous forme de biofilm sont en effet protégées de l’action du système immunitaire et ont une tolérance plus importante aux antibiotiques. À l’heure actuelle,

2016

Thèses de Médecine

  • thèse de Agathe Becker
  • le 04/10/2016
Présentation clinique et épidémiologie des infections ostéo-articulaires pubiennes : étude de cohorte rétrospective au sein de deux CRIOAc
Les infections ostéo-articulaires (IOA) du pubis sont des IOA peu fréquentes. Leur prise en charge est mal codifiée d’autant que les différents cadres nosologiques restent flous dans la littérature. L’objectif de cette étude de cohorte rétrospective menée au sein de deux CRIOAC (centres de référence pour la prise en charge des IOA complexes) était de décrire l’épidémiologie des IOA pubiennes,
  • thèse de Axelle Clerc
  • le 26/09/2016
Ostéomyélites hématogènes récidivantes a l’âge adulte
Objectif Décrire les caractéristiques épidémiologiques, cliniques, biologiques, radiologiques et la prise en charge des rechutes ostéomyélites à l’âge adulte. Méthode : Etude de cohorte rétrospective multicentrique conduite dans cinq centres français. Résultats Trente-sept patients ont été inclus. L’âge médian était de 40 ans (28-56), et 26 (70%) étaient de sexe masculin. Le fémur était le plus souvent atteint (n=23, 62%).

2015

Thèses de Médecine

  • thèse de Olivier Peeters
  • le 16/10/2015
Utilisation de la Téicoplanine dans les infections ostéo-articulaires à Staphylococcus aureus. Intérêt de la voie sous-cutanée dans l’optique d’une prise en charge ambulatoire
Objet de l’étude : Description de l’efficacité et la tolérance de la téicoplanine, en particulier par voie sous-cutanée, dans le traitement des infections ostéo-articulaires (IOA) à S. aureus. Méthodes: Etude rétrospective (2001-2011) monocentrique incluant toute IOA à S. aureus traitée par téicoplanine. Evaluation des risques d’échec et d’effets indésirables (EI, selon le Common Terminology Criteria for Adverse Events [CTCAE]). Résultats
  • thèse de Sandrine Roux
  • le 19/03/2015
Daptomycin > 6mg/kg/day as salvage therapy in patients with complex bone and joint infection: prospective cohort study in a regional reference center
Daptomycin does not have approval for the treatment of bone and joint infections (BJI). The Infectious Diseases Society of America guidelines propose daptomycin 6 mg/kg/d as alternative therapy for prosthetic joint infection, whereas recent data support the use of higher doses in these patients. Between 2010 and 2013, consecutive patients receiving daptomycin >6 mg/kg/d for complex BJI were included in

2014

Thèses de Médecine

  • thèse de Camille Chassin
  • le 11/12/2014
Prise en charge et devenir des infections ostéo-articulaires à Propionibacterium acnes : étude rétrospective de cohorte au sein des hospices civils de Lyon
Introduction: Les infections ostéo-articulaires (IOA)  dues à Propionibacterium acnes (P.acnes) sont connues pour être chroniques et souvent associées à une symptomatologie clinique pauvre. De diagnostique parfois difficile, ces infections représentent également un challenge thérapeutique et peu de données sont encore disponibles concernant le devenir des patients concernés. Les objectifs de cette étude sont d’analyser la prise en charge de ces

Thèses de Doctorat d’Université

  • thèse de Sophie Trouillet-Assant
  • le 12/12/2014
Physiopathologie des infections ostéo-articulaires à Staphylococcus aureus
Résumé Les infections ostéo-auriculaires (IOA), principalement causées par les staphylocoques, sont des infections graves, responsables d’un taux élevé de mortalité et de morbidité suite à l’inflammation et l’importante destruction osseuse. Nous avons étudié si les interactions hôtes-pathogènes pouvaient influer sur la présentation clinique (aiguë, chronique…) des IOA. Nous avons d’abord développé un modèle in vitro d’infection intracellulaire d’ostéoblastes humains permettant
  • thèse de Florent Valour
  • le 15/12/2014
Infections ostéo-articulaires à Staphylococcus aureus et Staphylococcus epidermidis : épidémiologie clinique et moléculaire, corrélation entre expression clinique et interaction staphylocoques – ostéoblastes
Le genre Staphylococcus, première étiologie des infections ostéo-articulaires (IOA), est associé à des formes particulièrement difficiles à traiter. Trois mécanismes phénotypiques ont été rattachés à ce fort taux de chronicité et de rechutes, permettant l’adaptation bactérienne à la vie au sein du tissu osseux et un échappement au système immunitaire de l’hôte et à l’action des antibiotiques : la formation

2013

Thèses de Médecine

  • thèse de Florent Valour
  • le 25/09/2013
Effets secondaires de l’antibiothérapie et pronostic des infections ostéo-articulaires à Staphylococcus aureus sensible à la meticilline: cohorte rétrospective monocentrique
Staphylococcus aureus représente le premier agent étiologique des infections ostéo-articulaires (IOA), engendrant des infections particulièrement difficiles à traiter. Les objectifs de cette étude étaient i) de décrire les effets secondaires de l’antibiothérapie prolongée des IOA à S. aureus, et ii) d’évaluer les facteurs de risque d’échec thérapeutique des infections sans matériel orthopédique. Deux cent patients ont été inclus (124 hommes

Thèses de Doctorat d’Université

  • thèse de Jean-Philippe Rasigade
  • le 11/01/2013
Internalisation et survie intracellulaire de S. aureus dans les ostéoblastes : rôle physiopathologique au cours de l’infection osseuse et impact des antibiotiques
L’invasion des ostéoblastes par Staphylococcus aureus (SA) est considérée comme responsable, au moins partiellement, de l’évolution chronique ou récurrente des infections osseuses (IO). Nous avons émis l’hypothèse que des différences d’interactions SA-ostéoblastes pouvaient être associées aux différences de présentation clinique des IO. Nous avons d’abord développé un modèle ex vivo d’infection intracellulaire d’ostéoblastes humains permettant de quantifier l’adhésion, l’invasion, la

2012

Thèses de Médecine

  • thèse de Judith Karsenty
  • le 04/10/2012
Effets indésirables liés à l’antibiothérapie au cours des spondylodiscites: cohorte historique monocentrique dans un service hospitalo-universitaire
Objectif de l’étude : Décrire les événements indésirables (EI) liés à l’antibiothérapie au cours du traitement des spondylodiscites (SDI) compliquées à pyogènes et d’étudier leurs facteurs de risque. Méthodes : Etude rétrospective incluant les patients présentant une SDI compliquée (immunodépression, complications locales à types d’abcès ou d’épidurite, présence de matériel) pris en charge dans le service de maladie infectieuse de

2011

Thèses de Médecine

  • thèse de Anissa Bouaziz
  • le 28/10/2011
Facteurs de risque d’échec au cours des infections de prothèse articulaire à S. aureus
Les infections sur prothèse articulaire (IPA) sont rares, potentiellement graves et difficiles à traiter. Staphylococcus aureus présente des facteurs de virulence et de persistance bien particuliers. Les IPA à S. aureus sont liées à des souches sensibles ou résistantes à la méticilline (respectivement MSSA et MRSA). Les souches MRSA appartiennent à des clones pandémiques (distingués par leur sequence type [ST])